Un amendement au Projet de loi de finances pour 2025, porté par Laurent Duplomb, sénateur LR de la Haute-Loire, et adopté le 17 janvier par le Sénat, prévoit de supprimer les financements (2,91 M€ en 2025) alloués à l’Agence BIO et de déléguer ses missions à l’administration. Ses missions pourraient, pour le sénateur, par exemple, être reprises par FranceAgriMer ou réinternalisées par les services du ministère de l’agriculture, de la souveraineté alimentaire et de la forêt. Les acteurs de la filière bio se mobilisent (communiqués de presse, réseaux sociaux, pétition en ligne…).